| 与普通柴油相比100%生物无醇燃料平均废气排放 | |
| 管制废气排放 | |
| 颗粒物 | -47% |
| 一氧化碳 | -48% |
| 未燃烧的碳氢化合物总量 | -67% |
| 氮氧化物 | +/- |
| 非管制排放 | |
| 硫酸盐 | -100% |
| 多环芳烃（PAH） | -80% |
| 硝化多环芳烃（nPAH） | -90% |
| 特种烃臭氧形成潜能 | -50% |
颗粒物（黑烟）颗粒物的排放与呼吸系统疾病有关，通常被认为是对人体健康的危害。生物无醇燃料使颗粒物的排放减少了47%；
一氧化碳一氧化碳是一种有毒气体、生物无醇燃料减少了48%左右；
未燃烧的碳氢化合物有助于局部形成烟雾、生物无醇燃料减少了67%；
氮氧化物有助于局部形成烟雾的化合物。根据NREL《生物柴油处理和使用指南2009》修订版（注：美国），对NOx测试结果的检查表明，生物无醇燃料的效果会随发动机设计、标定和测试周期而变化。
硫酸盐硫酸盐是酸雨的主要来源，使用生物无醇燃料时几乎消除了这类排放物；
多环芳烃（PAH和nPAH）这些化合物已被确定为致癌化合物，生物无醇燃料可将这些化合物的排放量减少多达85%（对于PAH化合物）和90%（对于nPAH化合物）；
特定烃类化合物有助于形成局部烟雾和臭氧，使用生物无醇燃料时从特定的碳氢化合物形成烟雾的可能性降低了50%；
减少生命周期的二氧化碳排放；
生物无醇燃料通过减少大气中的净碳排放量来帮助降低全球变暖的风险，生物无醇燃料燃烧时会向大气释放二氧化碳，但用于生产它们的农作物在其生长周期中会吸收大气中的二氧化碳。由美国农业部和美国能源部共同进行的一项研究确定，与石油柴油相比，生物无醇燃料可减少向大气中排放的二氧化碳净含量达78.5%以上。
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